В декабре 1937 года епископа отправили в пятилетнюю ссылку в Красноярский край, село Большая Мурта. Там ему дали возможность работать хирургом в районной больнице.
В октябре 1941 епископ Лука назначен консультантом всех госпиталей Красноярского края и главным хирургом эвакогоспиталя. После организации в Красноярске медицинского вуза прославленный хирург читал в нём лекции. Его деятельность была отмечена грамотой и благодарностью Boeнного совета Сибирского военного округа.
В 1942 году епископ Лука возведён в сан архиепископа и назначен на Красноярскую кафедру, при этом он, продолжал хирургическую работу, возвращая в строй защитников Отечества. Святитель ходатайствовал об открытии церкви в Красноярске. В начале марта 1943 года после Лука добился открытия маленькой кладбищенской церкви в слободе Николаевка.
Святитель Лука был причащён к лику святых Русской православной церкви в 2000 году.
В Красноярске его именем назван медицинский государственный университет. У Архиерейского дома ему установлен памятник. В школе № 10 Красноярска работает музей Святителя Луки.
