Своего опыта с детьми нет, да и дети все разные, но по общим соображениям:
Если Кронштадт считать Питером, то экскурсия на катере по фортам от ребят из компании ПоФортам.рф. Старт из форта. На экскурсии высаживаются на два-три форта в зависимости от программы. В подходящий ветер и прилив пришвартуются к маяку и дадут на него залезть (но это детям лучше заранее не обещать).
Гранд-макет «Россия» огромный и прикольный. Там всё ездит само. Трогать это нельзя, но есть разные интерактивные кнопки, которые запускают разные процессы. И вообще макет отличный.
Говорят, музей «Вселенная воды» бывает интересен детям. И там есть какой-то детский интерактив. Не знаю, правда, на какой возраст.
Детям с развитым чувтвом прекрасного может быть прикольно в «Эрарте». Картины трогать, конечно, нельзя, но какой-то интерактив с экспонатами там бывает. И есть прикольные мультимедийные комнаты (надо записываться по времени заранее).
ПС: Конкретно сейчас в очереди нигде стоять не получится. Почти всё доступно только по предварительным онлайн-билетам на конкретные слоты.