Подворье Свято-Троицкой Сергиевой лавры существовало в Москве с начала XVII века. В 1766 году настоятелем лавры становится наставник наследника престола Павла I архимандрит Платон (Левшин; †1812), в будущем митрополит Московский и Коломенский. С этого времени он активно принимается за благоустройство Троицкого подворья.
На протяжении целого столетия с Подворьем теснейшим образом была связана вся церковная жизнь Москвы — «Третьего Рима»: с 1815 по 1923 год оно являлось постоянной резиденцией московских митрополитов. Более 45 лет (с 1821 по 1867 год) прожил на подворье святитель Филарет (Дроздов; †1867) — «природный Патриарх Всероссийский», как называли его современники. Здесь совершал он свое самоотверженное архипастырское служение, молитвенно окормляя, наставляя и всячески помогая своей пастве. С 1868 года подворье становится резиденцией святителя Иннокентия (Вениаминова-Попова; †1879), митрополита Московского и Коломенского, просветившего светом Христовой веры народы Сибири, Дальнего Востока, Алеутских островов и Аляски, за свое миссионерское служение и проповедь слова Божия прозванного «апостолом Америки».
Сюда 5 ноября 1917 года будущий священномученик митрополит Киевский и Галицкий Владимир (Богоявленский; †1918) принес митрополиту Московскому и Коломенскому Тихону (Беллавину; †1925) весть об избрании его на Патриарший престол, вдовствовавший уже более двух веков. И укрывшемуся в тихом уголке столичного града подворью суждено было на несколько лет стать центром духовной и церковной жизни уже не только Москвы, но и всей России, причем в период самый сложный и трагический за всю историю Русской Православной Церкви. Здесь же в мае 1922 года святитель Тихон был арестован.
В разные годы своего земного служения посещал это место и проживали здесь святитель Игнатий (Брянчанинов; †1867) — подвижник благочестия, автор многочисленных творений, аскет и учитель христианской жизни; священномученик Владимир (Богоявленский; †1918) — строгий и мудрый архипастырь, пламенный проповедник, организатор духовного просвещения народа Божия, с 1898 по 1912 год занимавший московскую кафедру, первый из русских архиереев новой эпохи гонений принял мученический венец; святитель Макарий (Невский; †1926) — ревностный миссионер, просветитель алтайского края, молитвенник и аскет, занимавший с 1912 по 1917 год московскую кафедру…
До октябрьского переворота подворье неоднократно посещалось царствующими особами: императором Александром II с супругой императрицей Марией Александровной; наследником престола Николаем Александровичем; царственным страстотерпцем — императором Николаем II; преподобномученицей великой княгиней Елисаветой Феодоровной.
По благословению Святейшего Патриарха Алексия II в 1993 году, после периода лихолетья и запустения, иеромонах Лонгин (Корчагин), ныне епископ Саратовский и Вольский, начал возобновление монашеской и приходской жизни на Троицком подворье. Старанием насельников, работников и многих добровольных помощников жизнь подворья стала обретать полноту и должное устроение.
