Церковь Николая Чудотворца была построена в 1886-1891 году на средства местного купца Николая Черняковского, который и похоронен в церковном саду рядом с проториеем этого храма Федором.
Архитектура храма относится к русско-византийскому стилю. В храме два престола: во имя Святителя Николая и Александра Невского.
Наряду с Богоявленским собором, одной из важнейших архитектурных доминант Ишима является Никольская церковь. Храм строился в период с 1886 по 1891 годы на средства, завещанные Николаем Черняковским — одним из наиболее выдающихся и просвещенных представителей ишимского купечества. Архитектуру Никольской церкви можно отнести к русско-византийскому стилю, одним из ярких образцов которого является Храм Христа Спасителя в Москве. В храме было установлено два Святых престола: во имя Святителя Николая и Александра Невского. Церковь окружает живописный сад, в котором собраны многие редкие растения и кустарники, произрастающие в Сибири и Европейской России. В нем находятся могилы Николая Черняковского и протоирея Феодора — настоятеля храма, посадившего этот сад.
