Преображенская церковь — самый первый храм, построенный в Горном Алтае в новейшее время. В этом смысле он может считаться правопреемником главного храма центрального миссионерского стана Всемилостивого Спаса, бывшего некогда в Улале.
Строительству храма предшествовали длительные переговоры общины и городских властей. Последние категорически не хотели выделять общине место непосредственно в городе, да еще и рядом со школой. Однако, к 1988 году удается достичь согласия и, при активной помощи Бийского Свято-Успенского прихода между улицами Трудовой и им. А. Матросова начинается строительство Преображенской церкви на участке, который завещала Церкви одна из прихожанок. 30 августа 1988 в Горно-Алтайск прибыл настоятель прихода, священник Ростислав Кирашук. Богослужения стали совершаться регулярно, вначале в молитвенном доме, а с 24 октября 1989 года — в храме. Малое освящение совершали протоиерей Николай Войтович, архимандрит Ермоген (Росицкий) и иерей Ростислав Кирашук. Великое освящение Преображенской церкви совершил епископ Новосибирский и Барнаульский Тихон 18.08.1991 года.
